Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 PTI1YGR156W 1278 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 MPC3YGR243W 441 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 VMA5YKL080W 1179 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YBL028CYBL028C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RSM19YNR037C 276 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YPR053CYPR053C 456 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ECM18YDR125C 1362 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SRC1YML034W 2505 nt2.83□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 HRD1YOL013C 1656 nt2.82□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 TCB2YNL087W 3537 nt2.82□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YGR114CYGR114C 390 nt2.82□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.82□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ATG16YMR159C 453 nt2.82□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YNR062CYNR062C 984 nt2.82□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SEC15YGL233W 2733 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 KAP104YBR017C 2757 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 LRS4YDR439W 1044 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RPL23BYER117W 414 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RIF2YLR453C 1188 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 FIG1YBR040W 897 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YPR050CYPR050C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SEC27YGL137W 2670 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ILS1YBL076C 3219 nt2.81□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 BPT1YLL015W 4680 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 VPS9YML097C 1356 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ARF1YDL192W 546 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 HTA1YDR225W 399 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RMT2YDR465C 1239 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 MRM2YGL136C 963 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SDP1YIL113W 630 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 PHD1YKL043W 1101 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SMA2YML066C 1110 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YOL118CYOL118C 309 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 MDV1YJL112W 2145 nt2.8□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 TAO3YIL129C 7131 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SPH1YLR313C 1593 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RIF1YBR275C 5751 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 CHS3YBR023C 3498 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 PKP2YGL059W 1476 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RAD55YDR076W 1221 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SEM1YDR363W-A 270 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 GSP1YLR293C 660 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 CTL1YMR180C 963 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SSN8YNL025C 972 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SSU72YNL222W 621 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 PNO1YOR145C 825 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 RPL20BYOR312C 519 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 DIM1YPL266W 957 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ICS2YBR157C 768 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 NDC80YIL144W 2076 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SST2YLR452C 2097 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 PMR1YGL167C 2853 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ITC1YGL133W 3795 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YGR237CYGR237C 2358 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 TSC11YER093C 4293 nt2.79□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 GCD6YDR211W 2139 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ECM11YDR446W 909 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 VMA8YEL051W 771 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 HMF1YER057C 390 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 SEC14YMR079W 915 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 YMR087WYMR087W 855 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 AAR2YBL074C 1068 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 snR11snR11 258 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 CAT5YOR125C 702 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 APD1YBR151W 951 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 ERV15YBR210W 429 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 NMA111YNL123W 2994 nt2.78□□□□□ -1.96
RRP42Q12277 PFS1YHR185C 714 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 MMF1YIL051C 438 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 RPL8BYLL045C 771 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 PML39YML107C 1005 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 YPL107WYPL107W 747 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 RPL33AYPL143W 324 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 POL30YBR088C 777 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 CSH1YBR161W 1131 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 DUN1YDL101C 1542 nt2.77□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 VAS1YGR094W 3315 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 YDR131CYDR131C 1671 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 FUN30YAL019W 3396 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 PEF1YGR058W 1008 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 YGR073CYGR073C 372 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 YLR297WYLR297W 390 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 RPN13YLR421C 471 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 ECM13YBL043W 774 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 MCA1YOR197W 1299 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 TAF3YPL011C 1062 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 PRM4YPL156C 855 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 ATG29YPL166W 642 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 GYP7YDL234C 2241 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 VPS30YPL120W 1674 nt2.76□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 FRE2YKL220C 2136 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 PET100YDR079W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 AST2YER101C 1293 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 YGL138CYGL138C 1038 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 BRR6YGL247W 594 nt2.75□□□□□ -1.97
RRP42Q12277 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.75□□□□□ -1.97
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