Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 RPL20BYOR312C 519 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 CSH1YBR161W 1131 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 CTP1YBR291C 900 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 INP52YNL106C 3552 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 PUF6YDR496C 1971 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 DSE1YER124C 1722 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 AVT5YBL089W 1380 nt3.15□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 STU2YLR045C 2667 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 GCD2YGR083C 1956 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 DIG2YDR480W 972 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MET14YKL001C 609 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 RSF1YMR030W 1131 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SEC14YMR079W 915 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PEX15YOL044W 1152 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 LTP1YPR073C 486 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 DPB3YBR278W 606 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 BI3Q0115 1554 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 CDC55YGL190C 1581 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ADY4YLR227C 1482 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 AUS1YOR011W 4185 nt3.15□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PDS5YMR076C 3834 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 UBP14YBR058C 2346 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 UBC9YDL064W 474 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 RPB9YGL070C 369 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 TPM1YNL079C 600 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 CCL1YPR025C 1182 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YCK2YNL154C 1641 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ARP4YJL081C 1470 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 VPS53YJL029C 2469 nt3.14□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MED1YPR070W 1701 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 CPR1YDR155C 489 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MTC3YGL226W 372 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MRPL9YGR220C 810 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 RPL27AYHR010W 411 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SAM37YMR060C 984 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PNO1YOR145C 825 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ATG29YPL166W 642 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MRH4YGL064C 1686 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 FRE8YLR047C 2061 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 POL4YCR014C 1749 nt3.13□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 COP1YDL145C 3606 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ATP22YDR350C 2055 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ESL1YIL151C 3357 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PSF1YDR013W 627 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PET100YDR079W 336 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 FMN1YDR236C 657 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 APA2YDR530C 978 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PNC1YGL037C 651 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 RPL22AYLR061W 366 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PML39YML107C 1005 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MCA1YOR197W 1299 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SWD3YBR175W 948 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 URB2YJR041C 3525 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SAP1YER047C 2694 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 DSE4YNR067C 3354 nt3.12□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 CWH41YGL027C 2502 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YKL100CYKL100C 1764 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 RPL13AYDL082W 600 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YDR209CYDR209C 414 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 MEI4YER044C-A 1227 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 COBQ0105 1158 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SPT15YER148W 723 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 UPF3YGR072W 1164 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 NNF1YJR112W 606 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SRL1YOR247W 633 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YOR387CYOR387C 621 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YNL011CYNL011C 1335 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 GCN1YGL195W 8019 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YLR278CYLR278C 4026 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 GPI13YLL031C 3054 nt3.11□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SEM1YDR363W-A 270 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ARG3YJL088W 1017 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 TIF34YMR146C 1044 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YNL320WYNL320W 855 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 TSR4YOL022C 1227 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YPR027CYPR027C 834 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SOK1YDR006C 2706 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 ICR1ICR1 3199 nt3.1□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 DRS2YAL026C 4068 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 PLP1YDR183W 693 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 SGN1YIR001C 753 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 VPS25YJR102C 609 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 NDL1YLR254C 570 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 FMP41YNL168C 780 nt3.09□□□□□ -1.91
NFI1Q12216 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YCL019WYCL019W 5313 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 PEX5YDR244W 1839 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 MFA1YDR461W 111 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 MPC1YGL080W 393 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 PEX14YGL153W 1026 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YIL175WYIL175W 318 nt3.08□□□□□ -1.92
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