Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 TPD3YAL016W 1908 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 EXO84YBR102C 2262 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 TIF35YDR429C 825 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 GUK1YDR454C 564 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 YDR401WYDR401W 564 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 MEI5YPL121C 669 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 YAR1YPL239W 603 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 MIF2YKL089W 1650 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 SRG1SRG1 551 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 YPR077CYPR077C 372 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 DIT1YDR403W 1611 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 JSN1YJR091C 3276 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 PSK1YAL017W 4071 nt2.78□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 LDB17YDL146W 1476 nt2.78□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 GIS1YDR096W 2685 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 NSE1YLR007W 1011 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 TMA16YOR252W 537 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 JID1YPR061C 906 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 LYS9YNR050C 1341 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YRB1YDR002W 606 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YHR095WYHR095W 495 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 OST6YML019W 999 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 POS5YPL188W 1245 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 LAP3YNL239W 1365 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 ADK2YER170W 678 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 TWF1YGR080W 999 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 ARF3YOR094W 552 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 GRR1YJR090C 3456 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 GLO3YER122C 1482 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 RAD50YNL250W 3939 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YRB30YGL164C 1323 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 SOL3YHR163W 750 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YVH1YIR026C 1095 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 PSR1YLL010C 1284 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YSA1YBR111C 696 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 SKN7YHR206W 1869 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 VPS34YLR240W 2628 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YKR078WYKR078W 1758 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 THI22YPR121W 1719 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 STE12YHR084W 2067 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 SWD2YKL018W 990 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YBT1YLL048C 4986 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 SNU114YKL173W 3027 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YDL162CYDL162C 357 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 SAE2YGL175C 1038 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 ORM1YGR038W 669 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 PCD1YLR151C 1023 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 TRM7YBR061C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-BRQ12193 YIL024CYIL024C 570 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 ARA1YBR149W 1035 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 IOC3YFR013W 2364 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 NAT1YDL040C 2565 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 CDC55YGL190C 1581 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 SGM1YJR134C 2124 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 UTP14YML093W 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YIR040CYIR040C 333 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YBL012CYBL012C 402 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YNL165WYNL165W 1221 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YBR287WYBR287W 1284 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 ORC4YPR162C 1590 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YDL041WYDL041W 354 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 MMM1YLL006W 1281 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 TPT1YOL102C 693 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 ECM29YHL030W 5607 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YHC1YLR298C 696 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YOR392WYOR392W 444 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 SCH9YHR205W 2475 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 RPL27BYDR471W 411 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 GPB1YOR371C 2694 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 UBP12YJL197W 3765 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 LTE1YAL024C 4308 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 PHO13YDL236W 939 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 ADK1YDR226W 669 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YML053CYML053C 639 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 TRM732YMR259C 4263 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 SPC72YAL047C 1869 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 NUM1YDR150W 8247 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 YLR230WYLR230W 306 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 HEM4YOR278W 828 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 MDM20YOL076W 2391 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 SHE4YOR035C 2370 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 RKM3YBR030W 1659 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1B-BRQ12193 ADY4YLR227C 1482 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 HYP2YEL034W 474 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 AML1YGR001C 747 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 FAB1YFR019W 6837 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 VHR2YER064C 1518 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 RUF21RUF21 707 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 NCB2YDR397C 441 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 ERT1YBR239C 1590 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 FRE2YKL220C 2136 nt2.63□□□□□ -1.99
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