Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms