Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms