Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms