Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 IES6YEL044W 501 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 THO1YER063W 657 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 SNX4YJL036W 1272 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 EAF6YJR082C 342 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 ATX2YOR079C 942 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 CSM4YPL200W 471 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 YBR090CYBR090C 369 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 RPB5YBR154C 648 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 ADF1YCL058W-A 342 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 GLN4YOR168W 2430 nt4.16□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 SRP1YNL189W 1629 nt4.15□□□□□ -1.74
SGO1Q08490 snR5snR5 204 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 FIN1YDR130C 876 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 PEX10YDR265W 1014 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 NSA2YER126C 786 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 COQ9YLR201C 783 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YGK3YOL128C 1128 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YOR186WYOR186W 435 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 POF1YCL047C 777 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YMR046CYMR046C 1323 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 SEC2YNL272C 2280 nt4.15□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YPL109CYPL109C 1974 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 PIG2YIL045W 1617 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 snR9snR9 187 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDR114CYDR114C 303 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 VPS74YDR372C 1038 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 QCR10YHR001W-A 234 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YBL071CYBL071C 309 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 FYV12YOR183W 390 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 snR24snR24 89 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 LAS1YKR063C 1509 nt4.14□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 TEL1YBL088C 8364 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 PRP3YDR473C 1410 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ARO80YDR421W 2853 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 MSM1YGR171C 1728 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDL163WYDL163W 303 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 BRR6YGL247W 594 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 CIC1YHR052W 1131 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ERP1YAR002C-A 660 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RDN58-1RDN58-1 158 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RDN58-2RDN58-2 158 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 IGO1YNL157W 507 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 BUD27YFL023W 2391 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 CDC5YMR001C 2118 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 MIS1YBR084W 2928 nt4.13□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 JJJ1YNL227C 1773 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 TFB2YPL122C 1542 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ASM4YDL088C 1587 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 SLX8YER116C 825 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 BUD13YGL174W 801 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 IRC19YLL033W 693 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ILV5YLR355C 1188 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 NHX1YDR456W 1902 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RTT109YLL002W 1311 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 TCO89YPL180W 2400 nt4.12□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 SSH1YBR283C 1473 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ACK1YDL203C 1872 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 VPS27YNR006W 1869 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 GRS2YPR081C 1857 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YPD1YDL235C 504 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDR090CYDR090C 933 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 MIG3YER028C 1185 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 GLC7YER133W 939 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 SLX9YGR081C 633 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 SOL4YGR248W 768 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ECM34YHL043W 513 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 CFD1YIL003W 882 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RAD27YKL113C 1149 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RPL17AYKL180W 555 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YPT7YML001W 627 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YML053CYML053C 639 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YPR148CYPR148C 1308 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 PDR12YPL058C 4536 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 AVT2YEL064C 1443 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RRN7YJL025W 1545 nt4.11□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 SPT23YKL020C 3249 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDL050CYDL050C 372 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDR199WYDR199W 366 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 VAB2YEL005C 849 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 AGA2YGL032C 264 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 TAM41YGR046W 1158 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YHR097CYHR097C 1101 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YIL029CYIL029C 429 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 RPC37YKR025W 849 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YLR400WYLR400W 474 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 IMP1YMR150C 573 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YNL058CYNL058C 951 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 LEE1YPL054W 906 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 CUR1YPR158W 759 nt4.1□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 KRE2YDR483W 1329 nt4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.8 ms