Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LRP1Q07954 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms