Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN11Q06124 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms