Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms