Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREMQ03060 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREMQ03060 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREMQ03060 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREMQ03060 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREMQ03060 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREMQ03060 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREMQ03060 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREMQ03060 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREMQ03060 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREMQ03060 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREMQ03060 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREMQ03060 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREMQ03060 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREMQ03060 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREMQ03060 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms