Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms