Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP4Q02446 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP4Q02446 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP4Q02446 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP4Q02446 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP4Q02446 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP4Q02446 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP4Q02446 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms