Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFKB2Q00653 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKB2Q00653 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms