Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms