Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD1P98174 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD1P98174 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD1P98174 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD1P98174 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD1P98174 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGD1P98174 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms