Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms