Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-24P63145 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-24P63145 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms