Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF6P62330 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF6P62330 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARF6P62330 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF6P62330 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF6P62330 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF6P62330 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF6P62330 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF6P62330 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARF6P62330 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms