Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms