Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms