Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BACE1P56817 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BACE1P56817 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BACE1P56817 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BACE1P56817 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BACE1P56817 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms