Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX10P56693 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX10P56693 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX10P56693 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX10P56693 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX10P56693 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX10P56693 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX10P56693 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX10P56693 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX10P56693 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX10P56693 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX10P56693 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX10P56693 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX10P56693 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX10P56693 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms