Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1P56182 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1P56182 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP1P56182 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP1P56182 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP1P56182 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP1P56182 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP1P56182 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1P56182 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1P56182 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1P56182 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1P56182 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1P56182 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1P56182 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1P56182 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms