Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX9P55771 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX9P55771 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX9P55771 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX9P55771 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX9P55771 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX9P55771 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX9P55771 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX9P55771 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX9P55771 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX9P55771 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX9P55771 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX9P55771 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX9P55771 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX9P55771 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms