Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L1P55209 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L1P55209 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms