Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P54278 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P54278 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P54278 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P54278 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P54278 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P54278 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P54278 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P54278 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P54278 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P54278 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P54278 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P54278 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms