Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATN1P54259 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATN1P54259 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATN1P54259 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATN1P54259 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATN1P54259 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATN1P54259 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATN1P54259 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATN1P54259 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms