Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA4P51532 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA4P51532 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms