Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GATMP50440 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATMP50440 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATMP50440 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATMP50440 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATMP50440 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATMP50440 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms