Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF6P49848 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF6P49848 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF6P49848 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms