Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP4P49662 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP4P49662 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP4P49662 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP4P49662 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP4P49662 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP4P49662 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP4P49662 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP4P49662 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP4P49662 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP4P49662 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms