Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NESP48681 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NESP48681 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NESP48681 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NESP48681 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NESP48681 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NESP48681 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NESP48681 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NESP48681 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NESP48681 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NESP48681 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
NESP48681 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NESP48681 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NESP48681 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NESP48681 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NESP48681 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NESP48681 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NESP48681 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NESP48681 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NESP48681 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NESP48681 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NESP48681 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NESP48681 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NESP48681 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NESP48681 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NESP48681 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NESP48681 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
NESP48681 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NESP48681 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NESP48681 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms