Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSSP48449 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSSP48449 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSSP48449 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSSP48449 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms