Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A3P47895 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms