Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms