Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFMP43652 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFMP43652 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFMP43652 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFMP43652 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFMP43652 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFMP43652 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFMP43652 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFMP43652 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFMP43652 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFMP43652 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms