Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms