Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA4P41247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA4P41247 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms