Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 ORC1YML065W 2745 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YDL186WYDL186W 834 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 RMT2YDR465C 1239 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 KEG1YFR042W 603 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 SOL3YHR163W 750 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YLR339CYLR339C 552 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YAT2YER024W 2772 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 KAP104YBR017C 2757 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 DUF1YOL087C 3351 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 TOM70YNL121C 1854 nt3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 NUF2YOL069W 1356 nt3□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 GPP2YER062C 753 nt3□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YNL234WYNL234W 1281 nt3□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 INP52YNL106C 3552 nt3□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 PIN4YBL051C 2007 nt3□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 VIP1YLR410W 3441 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 RPL35BYDL136W 363 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 IZH1YDR492W 951 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YKR033CYKR033C 426 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 JIP3YLR331C 378 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 MCA1YOR197W 1299 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 PHO88YBR106W 567 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 AXL1YPR122W 3627 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 ITT1YML068W 1395 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 NDT80YHR124W 1884 nt2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 SPP382YLR424W 2127 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 PMI40YER003C 1290 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YIP5YGL161C 933 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 PCL7YIL050W 858 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YIL174WYIL174W 228 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 SWD2YKL018W 990 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 ENV10YLR065C 546 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 PRE8YML092C 753 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YMR178WYMR178W 825 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 snR11snR11 258 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YOR114WYOR114W 885 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YPR078CYPR078C 1119 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YPR142CYPR142C 564 nt2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 RPN4YDL020C 1596 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 VMA8YEL051W 771 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 ERP6YGL002W 651 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 PNC1YGL037C 651 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 EPT1YHR123W 1176 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 EBP2YKL172W 1284 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 TFA2YKR062W 987 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 SEC65YML105C 822 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 SAM37YMR060C 984 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YNL035CYNL035C 1170 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 AAH1YNL141W 1044 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 CET1YPL228W 1650 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 FRE8YLR047C 2061 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 ECM18YDR125C 1362 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 STE24YJR117W 1362 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 BNA4YBL098W 1383 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 HUL5YGL141W 2733 nt2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 ISC10YER180C 804 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 IMP3YHR148W 552 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 EMC2YJR088C 879 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 RUF20RUF20 443 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YNL184CYNL184C 327 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 SSU72YNL222W 621 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 MSN1YOL116W 1149 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 PFF1YBR074W 2931 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 MOT1YPL082C 5604 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YJR061WYJR061W 2808 nt2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 LRS4YDR439W 1044 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 SPT15YER148W 723 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 RPL24BYGR148C 468 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 PTI1YGR156W 1278 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 RPL14BYHL001W 417 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 MRPL27YBR282W 441 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 EXO84YBR102C 2262 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 MON1YGL124C 1935 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YPP1YGR198W 2454 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YML096WYML096W 1578 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 SEC7YDR170C 6030 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 PDC2YDR081C 2778 nt2.95□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 TAF2YCR042C 4224 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 MET5YJR137C 4329 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 RAX2YLR084C 3663 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 AIM6YDL237W 1173 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 DOG1YHR044C 741 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 GLG2YJL137C 1143 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 LAC1YKL008C 1257 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 FRE2YKL220C 2136 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YLR042CYLR042C 486 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YAR069CYAR069C 294 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YLR290CYLR290C 834 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YML037CYML037C 1023 nt2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P40486 YNL109WYNL109W 546 nt2.94□□□□□ -1.94
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