Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YNR065CYNR065C 3351 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 ISM1YPL040C 3009 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 AGE1YDR524C 1449 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PHM6YDR281C 315 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RMD6YEL072W 696 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RGI1YER067W 486 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MAG1YER142C 891 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 USE1YGL098W 738 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MND1YGL183C 660 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MIG2YGL209W 1149 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 AML1YGR001C 747 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PTI1YGR156W 1278 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RPF1YHR088W 888 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 GIM5YML094W 492 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YBL055CYBL055C 1257 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YOL029CYOL029C 606 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 SPN1YPR133C 1233 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 SPR3YGR059W 1539 nt3.13□□□□□ -1.91
AVT5P38176 IMD4YML056C 1575 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PHO5YBR093C 1404 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 AIM7YDR063W 450 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 DPP1YDR284C 870 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YJL175WYJL175W 513 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 SFT1YKL006C-A 294 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PRM6YML047C 1059 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 ATP11YNL315C 957 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RCN2YOR220W 798 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 HNT3YOR258W 654 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MEI5YPL121C 669 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TRM82YDR165W 1335 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 FRT2YAL028W 1587 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MFB1YDR219C 1398 nt3.12□□□□□ -1.91
AVT5P38176 AEP2YMR282C 1743 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 SMI1YGR229C 1518 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TAN1YGL232W 870 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TAD1YGL243W 1203 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 HIS5YIL116W 1158 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 ATG27YJL178C 816 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YJR111CYJR111C 852 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YJR141WYJR141W 1044 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RPS7AYOR096W 573 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 GPI1YGR216C 1830 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 UBX3YDL091C 1368 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MON1YGL124C 1935 nt3.11□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PEX1YKL197C 3132 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 ATG26YLR189C 3597 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TAO3YIL129C 7131 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 snR84snR84 550 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YDL228CYDL228C 642 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TGL2YDR058C 981 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MRPL9YGR220C 810 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YIL161WYIL161W 708 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YAL004WYAL004W 648 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MAK16YAL025C 921 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 ENT3YJR125C 1227 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YKR011CYKR011C 1062 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YLR290CYLR290C 834 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RPN13YLR421C 471 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 GLO1YML004C 981 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YMR144WYMR144W 1029 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 GRX7YBR014C 612 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PIN3YPR154W 648 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TAF1YGR274C 3201 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 SLF1YDR515W 1344 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 CAF130YGR134W 3369 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 NGG1YDR176W 2109 nt3.1□□□□□ -1.91
AVT5P38176 CSR2YPR030W 3366 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RIM1YCR028C-A 408 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RPS29BYDL061C 171 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 STE14YDR410C 720 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 GIM4YEL003W 336 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 PMI40YER003C 1290 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MAM1YER106W 909 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 YGR051CYGR051C 324 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 TVP18YMR071C 504 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 MIC27YNL100W 705 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RPS10AYOR293W 318 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 RSA1YPL193W 1146 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 DIB1YPR082C 432 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 ARL1YBR164C 552 nt3.09□□□□□ -1.91
AVT5P38176 NSA1YGL111W 1392 nt3.09□□□□□ -1.92
AVT5P38176 DOA4YDR069C 2781 nt3.09□□□□□ -1.92
AVT5P38176 BUD27YFL023W 2391 nt3.09□□□□□ -1.92
AVT5P38176 CDC5YMR001C 2118 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SEC6YIL068C 2418 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SNT1YCR033W 3681 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YDL016CYDL016C 303 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 FAP7YDL166C 594 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 AHA1YDR214W 1053 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YAP6YDR259C 1152 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YDR340WYDR340W 303 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YDR491CYDR491C 492 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YGR042WYGR042W 816 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YGR190CYGR190C 366 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 CFD1YIL003W 882 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YKT6YKL196C 603 nt3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms