Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms