Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SKA2-208ENST00000583927 533 ntTSL 210.91□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 57.38□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-210ENST00000584089 229 ntTSL 46.1□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 GNA11-204ENST00000587636 733 ntTSL 517.02■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 412.84□□□□□ -0.355e-13■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.031e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-218ENST00000548920 1358 ntTSL 527.73■■■□□ 2.031e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-215ENST00000463869 849 ntTSL 326.45■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-209ENST00000432805 1144 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.75■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-219ENST00000551054 1074 ntTSL 1 (best)25.58■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-217ENST00000546536 1089 ntTSL 224.66■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-207ENST00000421892 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.68■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C14orf80-213ENST00000455454 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.31■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 COLGALT1-204ENST00000597147 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.54■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 422.21■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 416.63■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 ADCY7-206ENST00000564044 575 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 31.8
GTF2F1P35269 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 426.31■■□□□ 1.83e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 524.37■■□□□ 1.493e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 SLC8B1-212ENST00000551230 549 ntTSL 420.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 SLC8B1-211ENST00000550672 2925 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 SLC8B1-216ENST00000553238 1675 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 LRP1-206ENST00000554118 418 ntTSL 28.43□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-213ENST00000576854 1374 nt25.51■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-204ENST00000486241 691 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 212.02□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-205ENST00000489287 465 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-207ENST00000498643 312 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YWHAE-203ENST00000469398 676 ntTSL 29.95□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-12■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 P2RX6-202ENST00000413302 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 P2RX6-209ENST00000591411 242 ntTSL 512.28□□□□□ -0.444e-9■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-206ENST00000478283 2594 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-203ENST00000474884 864 ntTSL 520.15■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-207ENST00000496288 879 ntTSL 219.25■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-204ENST00000475796 358 ntTSL 28.86□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 YTHDF2-205ENST00000476976 657 ntTSL 38.28□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 414.85□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 MROH1-204ENST00000527071 680 ntTSL 314.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ZNF609-203ENST00000558680 418 ntTSL 39.37□□□□□ -0.911e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ATG7-212ENST00000446110 435 ntTSL 36.11□□□□□ -1.431e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ATG7-208ENST00000427759 455 ntTSL 35.28□□□□□ -1.561e-14■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ZNF627-203ENST00000587939 591 ntTSL 415.22■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 ZNF627-202ENST00000585493 541 ntTSL 49.65□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 TRAF2-205ENST00000466107 233 ntTSL 312.7□□□□□ -0.387e-9■■■■■ 31.7
GTF2F1P35269 WDR73-215ENST00000560182 542 ntTSL 424.15■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-208ENST00000559126 2031 ntTSL 220.84■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-210ENST00000559224 788 ntTSL 518.21■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-205ENST00000558521 997 ntTSL 318.21■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-211ENST00000559452 1240 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-213ENST00000559994 2063 ntTSL 516.62■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-207ENST00000559015 2140 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-218ENST00000560966 5071 ntTSL 215.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-201ENST00000398528 1915 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-220ENST00000561434 582 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-219ENST00000561329 1007 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-209ENST00000559178 933 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-217ENST00000560835 582 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-203ENST00000558019 528 ntTSL 410.63□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-216ENST00000560252 1180 ntTSL 29.25□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 WDR73-221ENST00000561447 560 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 114 ms