Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFC1P35251 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RFC1P35251 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFC1P35251 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFC1P35251 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFC1P35251 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFC1P35251 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFC1P35251 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFC1P35251 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFC1P35251 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms