Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPC1P35052 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPC1P35052 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC1P35052 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms