Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKARP32238 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKARP32238 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKARP32238 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms