Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFNP31947 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFNP31947 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFNP31947 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFNP31947 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFNP31947 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFNP31947 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFNP31947 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFNP31947 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms