Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms