Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA11P31270 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms