Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC27P30260 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC27P30260 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC27P30260 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC27P30260 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC27P30260 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC27P30260 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC27P30260 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC27P30260 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC27P30260 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC27P30260 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms